Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYF2O95926 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYF2O95926 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYF2O95926 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SYF2O95926 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYF2O95926 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYF2O95926 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYF2O95926 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYF2O95926 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SYF2O95926 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYF2O95926 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYF2O95926 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYF2O95926 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYF2O95926 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYF2O95926 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SYF2O95926 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYF2O95926 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYF2O95926 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYF2O95926 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYF2O95926 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYF2O95926 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYF2O95926 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYF2O95926 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYF2O95926 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYF2O95926 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYF2O95926 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYF2O95926 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SYF2O95926 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SYF2O95926 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SYF2O95926 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms