Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSX5O60225 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSX5O60225 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSX5O60225 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSX5O60225 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSX5O60225 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSX5O60225 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SSX5O60225 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SSX5O60225 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms