Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNQ3O43525 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNQ3O43525 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms