Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms