Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NKD1Q969G9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms