Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pja2Q80U04 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pja2Q80U04 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms