Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYDE1Q6ZW31 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYDE1Q6ZW31 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms