Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NHSL1Q5SYE7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NHSL1Q5SYE7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
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