Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Skap2Q3UND0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skap2Q3UND0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms