Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCOA1Q15788 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
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NCOA1Q15788 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
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NCOA1Q15788 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
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NCOA1Q15788 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
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NCOA1Q15788 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
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NCOA1Q15788 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
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NCOA1Q15788 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
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NCOA1Q15788 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NCOA1Q15788 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
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