Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
DDX39BQ13838 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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