Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTCH1Q13635 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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