Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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GTF3C1Q12789 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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GTF3C1Q12789 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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GTF3C1Q12789 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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GTF3C1Q12789 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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GTF3C1Q12789 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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GTF3C1Q12789 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GTF3C1Q12789 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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