Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC173Q0VFZ6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC173Q0VFZ6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms