Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PLNP26678 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PLNP26678 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PLNP26678 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms