Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRHP20396 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRHP20396 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TRHP20396 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRHP20396 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRHP20396 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRHP20396 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRHP20396 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TRHP20396 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRHP20396 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRHP20396 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRHP20396 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRHP20396 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TRHP20396 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRHP20396 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TRHP20396 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRHP20396 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRHP20396 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRHP20396 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRHP20396 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRHP20396 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRHP20396 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRHP20396 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRHP20396 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRHP20396 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRHP20396 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRHP20396 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRHP20396 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRHP20396 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRHP20396 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRHP20396 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRHP20396 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRHP20396 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRHP20396 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRHP20396 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRHP20396 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TRHP20396 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRHP20396 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRHP20396 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRHP20396 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRHP20396 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRHP20396 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRHP20396 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRHP20396 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRHP20396 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRHP20396 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRHP20396 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRHP20396 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRHP20396 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRHP20396 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRHP20396 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TRHP20396 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRHP20396 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRHP20396 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRHP20396 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRHP20396 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRHP20396 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRHP20396 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRHP20396 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRHP20396 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRHP20396 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRHP20396 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRHP20396 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRHP20396 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRHP20396 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRHP20396 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRHP20396 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRHP20396 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRHP20396 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRHP20396 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRHP20396 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TRHP20396 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRHP20396 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRHP20396 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TRHP20396 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRHP20396 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRHP20396 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRHP20396 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRHP20396 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRHP20396 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TRHP20396 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRHP20396 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TRHP20396 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRHP20396 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRHP20396 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRHP20396 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRHP20396 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRHP20396 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRHP20396 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRHP20396 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TRHP20396 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRHP20396 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRHP20396 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRHP20396 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRHP20396 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRHP20396 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRHP20396 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRHP20396 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRHP20396 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRHP20396 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms