Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APAF1O14727 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APAF1O14727 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APAF1O14727 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APAF1O14727 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
APAF1O14727 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APAF1O14727 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
APAF1O14727 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
APAF1O14727 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
APAF1O14727 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APAF1O14727 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APAF1O14727 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APAF1O14727 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
APAF1O14727 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APAF1O14727 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
APAF1O14727 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APAF1O14727 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms