Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
AGRNO00468 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
AGRNO00468 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AGRNO00468 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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