Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
A3GALT2U3KPV4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A3GALT2U3KPV4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms