Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
USP20Q9Y2K6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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USP20Q9Y2K6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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USP20Q9Y2K6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
USP20Q9Y2K6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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