Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms