Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHPF2Q9P2E5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms