Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SEMA4CQ9C0C4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms