Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SORT1Q99523 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SORT1Q99523 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms