Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG3Q96JB2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms