Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PGAM5Q96HS1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PGAM5Q96HS1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PGAM5Q96HS1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PGAM5Q96HS1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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