Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atl3Q91YH5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms