Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF548Q8NEK5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF548Q8NEK5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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