Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDCL2Q8N4E4 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms