Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTXN3Q4LDR2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms