Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ptcd3Q14C51 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ptcd3Q14C51 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms