Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CBFBQ13951 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms