Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL16A1Q07092 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL16A1Q07092 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms