Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP1Q04837 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms