Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CACNA1DQ01668 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms