Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HPCAP84074 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HPCAP84074 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HPCAP84074 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HPCAP84074 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HPCAP84074 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HPCAP84074 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HPCAP84074 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HPCAP84074 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HPCAP84074 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HPCAP84074 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HPCAP84074 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HPCAP84074 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HPCAP84074 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HPCAP84074 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HPCAP84074 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms