Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRE11P49959 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRE11P49959 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRE11P49959 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRE11P49959 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MRE11P49959 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRE11P49959 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRE11P49959 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRE11P49959 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRE11P49959 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRE11P49959 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRE11P49959 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRE11P49959 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRE11P49959 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRE11P49959 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRE11P49959 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MRE11P49959 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRE11P49959 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRE11P49959 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRE11P49959 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRE11P49959 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRE11P49959 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRE11P49959 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRE11P49959 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRE11P49959 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRE11P49959 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRE11P49959 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRE11P49959 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRE11P49959 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRE11P49959 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRE11P49959 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
MRE11P49959 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRE11P49959 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRE11P49959 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRE11P49959 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRE11P49959 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRE11P49959 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRE11P49959 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRE11P49959 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRE11P49959 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRE11P49959 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRE11P49959 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRE11P49959 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRE11P49959 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRE11P49959 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRE11P49959 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRE11P49959 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRE11P49959 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRE11P49959 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRE11P49959 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRE11P49959 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRE11P49959 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRE11P49959 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRE11P49959 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRE11P49959 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRE11P49959 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRE11P49959 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRE11P49959 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRE11P49959 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRE11P49959 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRE11P49959 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRE11P49959 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRE11P49959 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRE11P49959 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MRE11P49959 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRE11P49959 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRE11P49959 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRE11P49959 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRE11P49959 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRE11P49959 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRE11P49959 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRE11P49959 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms