Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTSLP07711 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTSLP07711 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTSLP07711 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTSLP07711 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms