Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DQB1P01920 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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