Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
E2F6O75461 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
E2F6O75461 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
E2F6O75461 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
E2F6O75461 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
E2F6O75461 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
E2F6O75461 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
E2F6O75461 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
E2F6O75461 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms