Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PPFIA3O75145 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA3O75145 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA3O75145 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA3O75145 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA3O75145 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA3O75145 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA3O75145 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PPFIA3O75145 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIA3O75145 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIA3O75145 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms