Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPDC1A2A3K4 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms