Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF3Q9ULD4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms