Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PKDREJQ9NTG1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PKDREJQ9NTG1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms