Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nup50Q9JIH2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms