Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SIRT1Q96EB6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms