Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Snx8Q8CFD4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx8Q8CFD4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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