Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
C4orf17Q53FE4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C4orf17Q53FE4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms