Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TWISTNBQ3B726 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms