Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TXNRD1Q16881 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TXNRD1Q16881 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms